《表1 3个白鲫杂交子代的测序产量》

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《3种白鲫杂交子代的转录组学分析》

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为保证数据质量，对各测序样品的原始数据进行质控和过滤。去除低质量、含接头序列的reads后，得到的clean reads如表1所示。各样品测序质量不低于20（Q20）的碱基占总碱基比例均在96.00%以上，质量不低于30（Q30）的碱基占比在90.00%以上，GC含量则低于50.00%。采用Trinity对所有clean reads进行从头组装后，共得到225858条unigenes，总长150956990 bp，平均长度668 bp，N50为938 bp。其中，有102591条（45.42%）的unigenes长度在200～400bp，42555条（18.84%）的unigenes长度在400～600 bp，长度在1000 bp以上的unigenes有42723条（18.91%）（图1） 。