《表1 土壤中FOC4基因组提取率分析》
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《土壤中香蕉枯萎病菌FOC4的实时荧光定量PCR检测》
注:*:由于此样品核酸拷贝数低,做荧光定量PCR时采用模板体积为10μL
配制FOC4孢子含量梯度的标准土样,采用MoBio公司Power Soil DNA Isolation Kit试剂盒提取土样总DNA为模板,进行荧光定量检测标准土样的FOC4孢子含量,通过标准曲线计算各样本核酸拷贝数。样本定量拷贝数与理论拷贝数(假设FOC4孢子DNA提取率为100%)的比值为土壤中FOC4基因组的提取率。经对比发现,土壤中FOC4孢子的基因组提取率较低,土壤中FOC4孢子的含量越高,基因组提取率越高。当含量在1.66×104、1.66×105和1.66×1063个数量级时,FOC4的提取率在12.8%~13.5%,相对稳定。当FOC4孢子含量在1.66×103时,提取率不稳定(表1)。因香蕉枯萎病发病土壤的孢子含量在103~106之间,发病下限的孢子浓度为103 cfu/g土。提取土壤总DNA时,土壤中FOC4的提取率可采用13%对荧光定量检测值进行校正,还原土壤中FOC4的真实含量。
图表编号 | XD0088598300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.08.25 |
作者 | 魏森、陈汉清、曾涛、畅文军、李恒、曾会才 |
绘制单位 | 海南大学热带农林学院、中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海南省热带微生物资源重点实验室、中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海南省热带微生物资源重点实验室、海南大学热带农林学院、中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海南省热带微生物资源重点实验室、中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海南省热带微生物资源重点实验室、海 |
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