《表2 KEGG通路富集结果(前5)》
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《缺氧诱导GLC-82、A549肺癌细胞的microRNAs差异表达谱分析》
采取PCR方法验证芯片结果,显示芯片检查出变化差异的33个microRNAs均在细胞缺氧微环境中出现差异表达,其中has-miR-9-5p及has-miR-137在2种肺癌细胞中都呈上升趋势,其他microRNAs几乎为下降趋势。值得注意的是,has-miR-192-5p在A549细胞中为升高,但在GLC-82细胞中为下降。不同microRNAs分子调控的不同靶基因,在细胞生长中发挥重要作用。利用TargetScanHuman 7.2数据库预测相关靶基因,选取Total context score小于-0.4的靶基因(图4)。随后,通过KOBAS在线网站的KEGG通路富集功能及GO富集功能,对差异表达的microRNA分子调控的靶基因展开分析,KEGG通路富集结果显示,主要富集到的信号通路为肿瘤、胰岛素信号、Ras、肿瘤胆碱代谢、代谢相关通路(表2)。
图表编号 | XD0085921500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.28 |
作者 | 王莹、唐春明、李静林、邱丽娟、孙强明 |
绘制单位 | 昆明医科大学海源学院基础教学部病理教研室、云南省第一人民医院肿瘤内科、昆明医科大学第一附属医院急诊医学科、昆明市儿童医院儿科疾病研究所、中国医学科学院医学生物学研究所分子流行病联合实验室 |
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