《表1 吡咯里西啶类生物碱的名称和基因毒性数据值(CI)》

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《吡咯里西啶类生物碱基因毒性的构效关系研究》


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为了充分考查吡咯里西啶类生物碱的电负性、立体结构以及其他因素的影响,本研究在化合物定量构效关系(quantitative structure activity relationships,QSAR)计算中使用了13种分子参数。采用化学结构式编辑软件Chem BioOffice输入化合物的结构,然后采用分子模拟软件Hyperchem进行规则化处理,并且按梯度值(不超过0.1)进行几何优化和三维成像;利用半经验公式算法,测定吡咯里西啶类生物碱的分子体积(VOL)、分子表面积(SAA)、分子疏水系数(Log P)、分子网格表面积(SAG)、总能量(TE)、极化能(POLAR)、电子能(EE)、原子能(IAE)、分子键合能(BE)、核-核相互作用势(CCI)、摩尔折射率(RE)、生成热(HOF)、偶极矩(DIPOLE)等3D量子化学参数(13种);以吡咯里西啶类生物碱的基因毒性数据值(CI)作为自变量(表1)[5-9],采用Simca-p软件程序,建立因变量与自变量之间的PLS的定量构效关系模型,结果表明该QSAR模型具有较强的基因毒性预测能力。