《表2 旱胁迫下2个品种间差异可变剪切中的抗旱相关基因信息》

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《干旱胁迫下青稞全基因组可变剪切分析》


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研究发现2个品种在对照与处理下的差异可变剪切基因富集的通路有较大差异,在喜拉中,HVUL3H17775与HVUL1H10694分别参与了富集的4个通路中的3个通路。HVUL3H17775序列比对到GenBank的编号为BAJ86175.1,是一个预测的蛋白,其主要的功能是3-羟基酰基-CoA脱氢酶。HVUL1H10694为酰基辅酶A氧化酶4,过氧化物酶体,其主要的作用是酰基辅酶A氧化酶。HVUL0H14419(肌环己六氢醇2-脱氢酶)、HVUL2H19484(肌醇-五磷酸盐2-激酶)也参与了富集的通路。在以表达量为标准的差异分析模式下,未发生差异表达的基因之间存在的很多的剪切差异是被忽略的,而这些剪切可引起后续转录本及蛋白的不一致从而对植物的表型产生影响。从差异可变剪切的角度剖析不同品种在不同环境下的响应,为后续探究翻译这些酶蛋白的基因由于剪切而造成功能的变化奠定了基础。