《表1 宽带果实蝇样本信息》

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《基于mtDNA cox1和cox2基因的宽带果实蝇种群遗传结构分析》

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DNA序列使用BioEdit 7.09中的CLUSTAL W插件进行编辑整理（Hall，1999），采用MEGA4.0（Tamura et al.，2007）统计核苷酸组成、变异位点及简约信息。将所有联合DNA片段文件导入DnaSP5.0（Librado and Rozas，2009）中筛选并合并单倍型，按共享单倍型（Shared haplotypes）数字命名单倍型，统计其频率，各种群中的独享单倍型（Private haplotypes）合并为总频率。采用Arlequin 3.5（Excoffier and Lischer，2010）对各种群的核苷酸多样性（Nucleotide diversity）、单倍型多样性（Haplotype diversity）、种群间Fst值、错配分布系数（Mismatch distribution）、种群内Nei’s平均差异数（Nei’s average number of pairwise differences）和种群间基因流值、核苷酸差异平均数（Average number of nucleotide defference）、各种群遗传距离等指标。其中，Gamma值由j Model Test0.1.1（Guindon and Gascuel，2003；Posada，2008）检验获得。采用Arlequin 3.5对各种群进行中性检验（Neutrality test），计算得出Tajima’s D（Tajima，1989）和Fu’s Fs（Fu，1997）值、种群间Nei’s平均差异数、种群间Fst值。使用Network 4.6（Bandelt et al.，1999）构建单倍型中介网络图（Median-joining network），以瓜实蝇Zeugodacus cucurbitae序列作为参照，推断祖先单倍型和进化分支。