《表2 α-多样性指数统计结果》

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《黄水溪砷环境地球化学迁移行为及其细菌群落分析》


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基于IonS5TMXL测序平台,利用单端测序(Single-End)的方法,构建小片段文库进行单端测序,IonS5TMXL下机数据使用Cutadapt软件过滤和按barcode拆分样本后,根据97%相似性对序列进行OTU的聚类.该研究利用高通量测序得到9 410个OTUs(表示一组来源于某一个相同分类单元的序列),共注释到58个门类.由α-多样性指数(见表2)可知,样品文库的覆盖率指数(coverage)皆大于98%,表示测序结果能够代表样本的真实情况.9号采样点群落丰富度指数(Chao1指数和ACE指数)和Shannon-Wiener指数明显小于其他采样点,Simpson指数在几个采样点之间没有明显的差别.呈现种群丰富度和多样性降低现象的原因可能是水环境中ρ(AsT)的增高;Ghosh等[38]研究印度西孟加拉邦三角洲细菌群落多样性时发现,富As含水层细菌群落减少.