《表2 ARID1A潜在的合成致死基因》
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《基于合成致死策略寻找ARID1A突变肝细胞癌的治疗靶点》
注:表中展示的基因是p<0.3,p值为费舍尔精确检验结果
为了减小靶基因范围,本研究选用显著性差异p<0.05的Achilles癌症细胞系的低GPV和NCI-60细胞系的高表达基因分析两种算法获得的共同基因有3个:UBOX5、ZNF174、BCLAF1。由于得到的基因数太少,本研究选择扩大入选基因范围来改进算法,选择所有低GPV基因和高表达基因分析获得重叠基因,在TCGA肝癌数据库进行突变互斥性分析验证低GPV和高表达的重叠基因,获得了196个潜在的合成致死基因(图3A;表2)。
图表编号 | XD0062472700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.25 |
作者 | 王光兴、石毅、王小晟、张跃、韩泽广、何昆燕 |
绘制单位 | 上海交通大学系统生物医学研究院系统生物医学教育部重点实验室、上海交通大学系统生物医学研究院系统生物医学教育部重点实验室、中国药科大学基础医学与临床药学学院基础医学系、哈尔滨医科大学第一临床医学院风湿免疫科、上海交通大学系统生物医学研究院系统生物医学教育部重点实验室、上海交通大学系统生物医学研究院系统生物医学教育部重点实验室 |
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