《表1 发生显著变化的代谢物及其相关系数》
细胞和细胞培养基水相提取物的NMR谱图积分数据经PCA分析后得分图如图3(a)和3(b)所示,无论是细胞提取物[图3(a)]还是培养基[图3(b)]提取物,JEG3和JEG3R间分离趋势均很明显,且未发现异常点.然后分别对细胞和培养基提取物的数据建立OPLS-DA模型,并采用交叉验证和CV-ANOVA分析验证模型可靠性,结果显示两组OPLS-DA分析均提示模型是成立的.通过对OPLS-DA的loading值进行回溯变换[22],将发生显著变化的代谢物展示在相关系数负载图[图3(c)]中.同时通过计算模型中Pearson相关系数,挑选出相关系数大于0.576的代谢物,此即对模型的分离具有重要贡献的差异代谢物(表1).在细胞提取物中,相比于JEG3敏感细胞,JEG3R耐药细胞中山梨糖醇和胆碱含量更高,而缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、丙氨酸、谷氨酸、甘氨酸、酪氨酸、组氨酸、苯丙氨酸、磷酸胆碱、二磷酸尿苷葡萄糖、鸟苷三磷酸、腺苷一磷酸、尿苷一磷酸和延胡索酸含量较低.在培养基提取物中,与JEG3敏感细胞的培养基相比,JEG3R耐药细胞的培养基含有较高水平的缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸、乳酸、乙酸、延胡索酸和甲酸,以及较低水平的甘油、丙酮酸、丙氨酸、3-甲基-2-氧基戊酸、2-氧代亮氨酸和2-氧基异戊酸.
图表编号 | XD006005000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.01 |
作者 | 丁来丰、张聪聪、胡庆宇、Olivier E.PARDO、Michael J.SECKL、王玉兰、吴俊芳 |
绘制单位 | 波谱与原子分子物理国家重点实验室武汉磁共振中心(中国科学院武汉物理与数学研究所)、中国科学院大学、复旦大学生命科学学院、波谱与原子分子物理国家重点实验室武汉磁共振中心(中国科学院武汉物理与数学研究所)、中国科学院大学、Division of Cancer, Department of Surgery and Cancer,Imperial College London、Division of Cancer, Department of Surgery and Cancer,Imperial College |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |