《表1 多态性连锁分子标记及序列》

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《水稻颖花畸形突变体(gm(t))的遗传分析与基因定位》

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设计加密SSR和InDel分子标记，先用两亲本多态性筛选并获得了4对多态性分子标记（表1）。缩小定位范围，最终将颖花畸形基因定位在ZM506和RM3463之间，即物理位置在大约在6号染色体1.254 Mb至2.110 Mb之间（图2B）。检索国家水稻数据中心网站（http://www.Ricedata.cn）发现颖花畸形基因gm（t）的定位区间内包含1个内颖形成调控基因DP1（LOC＿Os06g04540）。突变体dp1在编码区存在三个单核苷酸突变，184位的G突变到T，723位的G突变成T，863位的A到突变到C。为了证明15C197野生型与这个基因的关系，以日本晴的基因序列为参考设计引物（5'-AAACCAAACCCCTCGCCT-3'，5'-TAACCATCCAACCATCCTTAGC-3'），扩增野生型（15C197）和突变体的DP1基因全长序列并测序。结果表明：突变体gm（t）的DP1基因有19 bp碱基的缺失，该缺失会引起移码突变（图3）。鉴于gm（t）与dp1突变体的表型相似，gm（t）可能是DP1的一个等位突变基因。