《表5 上调差异基因KEGG富集分析》

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《拟南芥子叶与真叶差异基因的生物信息分析》

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气泡图直观展示出差异基因主要富集到脂肪酸延长、生物素代谢、光合固碳、硫锌酸代谢、鞘糖脂的生物合成等（图2）。通过P值校正来排除假阳性后，富集程度最高的是脂肪酸代谢，其次是生物素代谢。脂肪酸延伸通路，P值校正后为0.01，差异仍显著。将上调差异基因和下调差异基因分别做KEGG富集分析，按校正后的P值，排前十的结果。上调差异基因的富集分析，P值校正后显著的通路主要是脂肪酸延长、生物素的代谢、光合生物固碳等（表5）。下调差异基因的富集分析，P值校正后显著的通路主要是脂肪酸延长、淀粉与蔗糖代谢、次生代谢产物生物合成等（表6）。以上结果揭示出真叶相对于子叶来说，代谢通路确实发生了变化，它的光合作用相关通路基因大量表达，而糖原以及次级代谢通路基因的表达出现了下降。