《表1 数据质量控制的统计》

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《拟南芥子叶与真叶差异基因的生物信息分析》

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注:Q20:错误识别的概率是1%；Q30:错误识别的概率是0.1%；cot:子叶；ftl:第一对真叶

Illumina测序时，会在结果文件里给出碱基测序的质量值，用来表示该位点碱基质量好坏，Q20代表错误识别的概率是1%，即错误率1%，或者正确率是99%，Q30代表错误识别的概率是0.1%，即错误率0.1%，或者正确率是99.9%，公司下机的数据，Q20、Q30均在90%以上，说明测序部分的整体质量很高（表1），原始序列数据和质控后序列数据为质量控制完成后的数据结果，用于后续生物信息学分析。