《表1 GPR40受体活性小分子结构及p Ki值》

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《GPR40受体苯丙酸类激动剂三维定量构效关系研究》

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*为测试集分子 （8个小分子）

从文献[5～7]中获得共40个GPR40受体激动剂小分子（分子母核见图式1），文献所提供活性值为Ki值，根据研究所需，需将这些活性值转换为p Ki值（-log Ki），见表1。分子构建及结构优化等过程的运算参数除标明外均设为默认。通过SYBYL-X 2.0软件构建小分子三维结构，并加氢处理。结构优化时，首先以最陡下降法（Steepest descent method）来寻找分子低能构象，参数设置如下，收敛RMS参数:0.05kcal·mol-1·-1，最大迭代步数（Max Iterations）:6000；随后使用共轭梯度法进一步优化分子构象，参数设置如下，收敛RMS参数:0.001kcal·mol-1·-1，最大迭代步数（Max Iterations）:1000；最后利用GasteigerHückel法计算分子电荷，即得能量最低的药物分子构象。