《表2 48对SSR引物在80份烟草材料中的遗传多样性》

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《基于SSR标记的80份烟草种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析》


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从175对SSR引物中筛选出48对条带清晰、杂带较少且多态性较好的引物。扩增结果(表2,图1)显示,48对引物在80份种质资源中共扩增出211个等位基因,每对引物扩增等位基因数在2~20范围内,平均每个位点为4.396个。有效等位基因数(Ne)的平均值为2.902,其中PT30245的有效等位基因数最多,为11.278,PT50267的有效等位基因数最少,是1.358。Shannon′s信息指数(I)范围为0.433~2.608,平均值为1.034。平均Nei′s多样性指数(H)的变化范围为0.060~0.709,平均值为0.431。PT60715引物观测杂合度(Ho)的值最大,为0.950,最小值为0.013(PT61104)。期望杂合度(He)变化范围为0.265~0.917,平均值为0.572。平均多态性信息含量为0.494,变幅为0.229~0.905。当位点的PIC值小于0.25时,为低态位位点,该研究中最小的PIC值为0.229,低态位点只有1个;当位点的PIC值大于0.50时为高态位位点,此研究中共有21个,其中PT30245标记PIC值最高,为0.905。其余26个位点为中度多态位点,其PIC值范围为0.25~0.50。