《表1 试验材料及测序数据概况》
Q20:错误率在1%以下的碱基所占的百分比;Q30:错误率在0.1%以下的碱基所占的百分比Q20:the percentage of the bases with error rates below 1%,Q30:the percentage of the bases with error rates below 0.1%
100份古茶树资源共获得62.95G高质量测序数据,平均每个样品获得0.63G数据,碱基错误率在1%以下(Q20)的平均占比96.44%,而错误率低于0.1%(Q30)的平均占比91.13%,表明测序质量较高。100份资源平均获得高质量序列条数4.69百万条,平均有4.54百万的序列条数可以比对到茶树参考基因组,平均比对率为96.68%,平均测序深度11.72。平均比对率和平均测序深度满足重测序分析要求,可以进行后续分析。测序获得的原始数据(raw data)已上传BIG Data Center的Genome Sequence Archive(GSA)数据库(Accession number:CRA000946)。每个样品的数据概况如表1所示。
图表编号 | XD0049129900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.16 |
作者 | 郭燕、乔大河、杨春、李燕、陈正武、陈娟 |
绘制单位 | 贵州省农业科学院茶叶研究所、贵州省农业科学院茶叶研究所、贵州省农业科学院茶叶研究所、贵州省农业科学院茶叶研究所、贵州省农业科学院茶叶研究所、贵州省农业科学院茶叶研究所 |
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