《表1 试验材料及测序数据概况》

《表1 试验材料及测序数据概况》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《基于全基因组SNP的贵州久安古茶树遗传关系分析》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录
Q20:错误率在1%以下的碱基所占的百分比;Q30:错误率在0.1%以下的碱基所占的百分比Q20:the percentage of the bases with error rates below 1%,Q30:the percentage of the bases with error rates below 0.1%

100份古茶树资源共获得62.95G高质量测序数据,平均每个样品获得0.63G数据,碱基错误率在1%以下(Q20)的平均占比96.44%,而错误率低于0.1%(Q30)的平均占比91.13%,表明测序质量较高。100份资源平均获得高质量序列条数4.69百万条,平均有4.54百万的序列条数可以比对到茶树参考基因组,平均比对率为96.68%,平均测序深度11.72。平均比对率和平均测序深度满足重测序分析要求,可以进行后续分析。测序获得的原始数据(raw data)已上传BIG Data Center的Genome Sequence Archive(GSA)数据库(Accession number:CRA000946)。每个样品的数据概况如表1所示。