《表2 发卡结构分析：猪繁殖呼吸综合征病毒的NSP7蛋白密码子优化和表达及其免疫学活性鉴定》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《猪繁殖呼吸综合征病毒的NSP7蛋白密码子优化和表达及其免疫学活性鉴定》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

在线网站http://biotech.ou.edu/分析重组NSP7可溶性表达概率为0，由于蛋白稳定性、mRNA稳定性和翻译效率对蛋白产量和可溶性起主要作用所以在不改变NSP7氨基酸序列的前提下，综合考虑NSP7基因的（G+C）%含量、CAI-密码子适应指数、mRNA二级结构等因素，对目的基因进行优化以期增加重组蛋白的表达量和让重组蛋白可溶性表达。由于较低的GC含量有利于提高重组蛋白的表达量和利于提高可溶性表达的概率，于是利用NGTMCodon优化软件分析蓝耳病毒NSP7未优化前的基因GC含量为52%（图1B），优化后GC含量为51%（图1A）。如果基因的同义密码子与表达宿主的密码子偏好性相匹配的话可以在一定程度上提高重组蛋白的表达量，所以利用NGTMCodon优化软件分析优化蓝耳病毒NSP7基因，由图可见未优化的NSP7基因CAI（Codon Adaption Index）只有0.58（图1D），优化后的基因CAI（Codon Adaption Index）为0.81（图1C）。mRNA二级结构是另一影响翻译过程的因素，如表2所示:NSP7基因未优化前小发卡、中发卡、大发卡分别为5个、3个、2个，经过软件优化后小发卡只有2个而中发卡和大发卡皆为0。