《表2 忽地笑居群的psb A-trn H序列特征》

《表2 忽地笑居群的psb A-trn H序列特征》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《不同产地忽地笑的叶绿体基因psb A-trn H序列分析》


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“·”代表与湖南洪江序列位点相同;“-”代表碱基缺失;“+”代表TCCCCCG;“※”代表GGTTATC;“∴”代表TGAATGATAAGTATCTTTTTTTTGATTC;“∷”代表AAATTAACGACGAGATTTATTATCGTTTCTCGCATGT“·”:The base is same with site of Hongjiang population in Hunan;“-”:absence;“+

通过对我国52个不同产地忽地笑居群的叶绿体基因psb A-trn H序列进行测序,进行比对后发现序列长度变化范围为544~656 bp,核苷酸构成富含AT碱基,其含量为63.0%~64.2%,GC含量为35.8%~37.0%,远低于AT含量;当空位(gap)作为缺失处理时,52个居群序列检测到变异(多态性)位点数共33个,其中简约信息位点9个,单一突变位点18个,插入/缺失片段6个(表2),分别占序列总数的1.35%、2.70%和0.90%。由表2可知,9个简约信息位点分别出现在第17、41、54、58、136、189、499、650、651位点;在第138~228位点之间出现多个碱基缺失/插入或突变,该序列的6个插入/缺失片段均出现该片段区域,分别在第138~140、141~145、157~159、161~188、190~226、227~228位点;同一区域(省市)或地理分布较近的居群样品之间序列变化相同或相近,如12个湖南居群中除湖南城步(HNCB)在第227~228位点插入CT 2个碱基外,其余11个居群均缺乏第138~228 bp位点之间91 bp碱基片段,并且分布在周边的贵州、湖北等省份也表现出相似的序列特点等。