《表1 通过系统作图得到的来自大肠埃希菌42个SNPs和金黄色葡萄球菌12个SNPs组成的54对显著SNPs的基因注释》
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《利用系统作图(Systems mapping)研究大肠埃希菌和金黄色葡萄球菌的互作遗传机制》
注:-:位于2个基因之间.Note:-:Located between two genes.
检测到的显著SNPs所定位的候选基因进行了基因注释(表1),并且部分基因已经有文献报道了其详细功能,其中nhaR(E19056)是转录调控因子LysR家族的DNA结合蛋白,这个基因可以激活pgaABCD操纵子从而产生生物膜粘附素,生物膜粘附素可以使革兰氏阴性菌和金黄色葡萄球菌的生物膜结构更加稳定。候选基因sucA(E759230)参与生物体内十分重要的三羧酸循环(TCA)。rhlE(E832164)编码的蛋白功能是ATP酶和RNA解旋酶。csiD(E2789300)可以构成一个由σS因子控制的基因簇csiD-ygaF-gabDTP,它可以在碳源缺乏时被激活从而应对饥饿压力。alkB(E2309274)基因编码的AlkB蛋白参与烷基化损伤后的细胞恢复。yjjW(E4614704)基因编码丙酮酸-甲酸裂解酶激活酶同系物。
图表编号 | XD0043794200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.20 |
作者 | 张佐然、李金婷、梁雅静、张琦、金一、何晓青 |
绘制单位 | 北京林业大学生物科学与技术学院、北京林业大学生物科学与技术学院、北京林业大学生物科学与技术学院、北京林业大学生物科学与技术学院、北京林业大学生物科学与技术学院、北京林业大学生物科学与技术学院 |
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