《表1 3个物种的数据组成》

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《一种基于压缩感知和动态时间规整的信号肽特征提取新算法》


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实验采用的标准数据集来源于Nielsen等发布的网站http://www.cbs.dtu.dk/ftp/signalp/[18]。选择了其中3个物种:(1)真核细胞(Eukaryotes),(2) 革兰氏阳性真细菌(Gram+bacteria),(3) 革兰氏阴性真细菌(Gram-bacteria)。对于分泌蛋白,数据集中给出的是信号肽的扩展序列,就是延长到包括部分成熟蛋白序列(与信号肽相邻的30个氨基酸残基)。对于非分泌蛋白,由于不存在信号肽,数据集中给出的是前70个氨基酸残基组成的序列片段。数据集信息如表1所示。