《表1 GENIA V3.02语料库中实体标签分布》

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《BioTrHMM:基于迁移学习的生物医学命名实体识别算法》

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为了验证本文算法对生物医学命名实体识别的预测性能，选取传统的HMM算法与本文提出的基于迁移学习的Bio Tr HMM算法进行比较。目前，最常用的生物医学标注语料库是GENIA v3.02语料库，该语料库包含了来自MEDLINE的2 000个摘要标注文本（约360 000个单词），并且包含了36个词性类别，其中包含5个生物医学实体类型，本文使用了GE-NIA v3.02语料库（http://www.nactem.ac.uk/genia/genia-corpus）的数据进行实验。本文识别的是蛋白质命名实体，采用了精确率、召回率和F值[17]作为评价指标。GENIA v3.02语料库中实体标签分布说明如表1所示。