《表1 检测自然选择的经典统计学方法》

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《群体基因组学方法:从经典统计学到有监督学习》

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以遗传多样性变化为依据、构建单一统计量来检测自然选择的经典统计学方法可具体划分为四大类[34～36]:基于比率的方法、基于基因频率的方法、基于连锁不平衡和选择扫荡的方法、基于种群分化的方法，这些方法能够从宏观或微观的层面检测自然选择.例如，中国科学院北京基因组所的陈华研究组所开发的hmmSweep[37]和XP-CLR（the cross-population composite likelihood ratio method）[38]，以及Yi等人[39]的PBS（population branch statistic）分别使用基于连锁不平衡、选择扫荡和种群分化的方法检测自然选择，均取得了积极的研究进展.根据Vitti等人[34]和Akey[40]的总结，加上我们的补充完善，在表1中列出了一些具有代表性的具体方法.