《表3 单环刺螠不同群体的遗传变异参数》

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《基于线粒体COI序列莱州湾单环刺螠遗传多样性分析》

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单环刺螠COI序列扩增特异引物（CXF、CXR）扩增效果较好（图1），后生动物通用引物（LCO、HCO）扩增效果较差。扩增后单环刺螠COI序列全长1 533 bp，去除去掉两端有误差的序列，最终得到用于分析的1 309 bp碱基序列，84个样本中，除去测序失败和序列过短的14个样本，用于最终分析的样本为70个。将单环刺螠COI序列70个样本的全部序列作为一个共同数据矩阵，用DnaSP软件进行处理。结果发现:单环刺螠COI序列有变异位点数125个，其中43个单一变异位点，82个简约信息位点；48个单倍型，单倍型多样性0.977；单倍型多样性方差0.00079，单倍型多样性标准差为0.028；核苷酸多样性指数为0.01048；平均核苷酸差异数量为13.725。平均碱基组成:A，26.3%；G，17.6%；C，24.2%；T，31.8%；A+T（58.1%）含量高于G+C（41.9%）含量。不同群体的遗传变异参数见表3。莱州湾单环刺螠70个体的聚类图见图2，其中样品1-1～1-21为潍坊莱州湾单环刺螠保护区地理种群（群体1）；样品2-1～2-30为莱州浅滩保护区地理种群（群体2）；样品3-1～3-34为昌邑海区地理种群（群体3）。从图2中可见，70个个体聚类并没有体现出和地理位置相关。