《表1 4个mi RNA家族在参薯基因组中的分布》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《参薯microRNA基因挖掘与特征分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

为了对参薯基因组的miRNA基因进行预测，我们以miRBase数据库的成熟miRNA序列作为索引序列，使用FASTA软件比对参薯的基因组序列，之后截取匹配位点上下游各300 bp，通过RNAfold和Mi Rcheck软件的分析，获得参薯miRNA基因的前体miRNA和成熟miRNA序列，对miR159，miR164，miR167和miR168这4个miRNA家族进行了预测和分析，共在参薯基因组上找到了13个基因位点（表1）。其中miR159所预测的位点数最多（8个），其次为miR164（3个），其余两个家族各找到两个位点。这13个miRNA基因的前体序列长度在77～212 bp区间内，其中最长的是pre-miR159-7，为212 bp，而pre-miR167-1，pre-miR167-2，pre-miR159-2等5个miRNA基因的前体序列长度为80 bp左右。在预测的成熟miRNA序列中，miR159的不同基因位点的成熟miRNA序列5端一致，只是在miRNA长度上有1～2个碱基的差异。