《表5 霍山石斛SSR引物序列》

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《霍山石斛叶转录组中SSR位点信息分析》


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石斛多糖是霍山石斛中的主要有效成分之一。针对SSR重复单元左右序列≥150 bp的Unigene,设计出13960对SSR引物,对已得到的13960对SSR引物所对应的Unigene序列与霍山石斛糖代谢相关的SSR位点进行筛选。发现UDP-糖基转移酶(UDP-glycosyl transferase)、磷酸甘露糖变位酶(phosphomannomutase)、半乳糖脱氢酶(galactose dehydrogenase)、UDP-阿拉伯吡喃糖变位酶(UDP-arabinopyranose mutase)、木糖异构酶(xylose isomerase)、蔗糖磷酸合成酶(sucrose-phosphate synthase)6个内部含有SSR位点的霍山石斛糖代谢相关基因中含有合适的SSR引物(表5)。