《表2 甲基化条带情况分类Table 2Methylation band classification》
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《缺氮胁迫下雨生红球藻虾青素积累过程中的基因组MSAP分析》
将11对选择性扩增引物组合进行雨生红球藻DNA样品的全基因组甲基化分析(图4)。对上述胶图进行条带统计后,按Tang et al(2014)的方法进行分类,具体分类如表2所示。甲基化一共有四种类型:(I)HpaⅡ和Msp I处均有带(1,1),即没有发生甲基化;(Ⅱ)HpaⅡ无带,Msp I有带(0,1),为内部胞嘧啶发生全甲基化;(Ⅲ)HpaⅡ有带,Msp I无带(1,0),为外侧胞嘧啶半甲基化;(IV)HpaⅡ和Msp I处均无带(0,0),为超甲基化位点。经统计后,得到各类条带数目如图5所示。共得到1 265个条带,从这些条带中得到291个甲基化多态性位点。I类(未发生甲基化)数目最多,在缺氮处理0、24、72 h时分别为194、176、203个;Ⅱ类在缺氮处理的三个时间点变化不大;Ⅲ类在缺氮胁迫24 h和72 h时减少了86.49%,变化显著;IV类较稳定,在缺氮处理72 h时达64个,在三个时间点中数目最多。
图表编号 | XD0022854700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.09.01 |
作者 | 张克亚、卿人韦、柳科欢、刘倩倩、侯兴国、兰利琼 |
绘制单位 | 四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室、四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室、四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室、四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室、四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室、四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室 |
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