《表2 8个样品中检测到的OTUs数量及分类学分析》

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《基于Miseq测序分析海南阿宽蕉居群根际土壤细菌群落多样性》


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8个样品所产生的OTUs分类学分析结果显示,在8个样品中,总共检测到了25个门,96个纲,212个目,398个科,768个属。在门的水平,样品Xuxx29检测到菌门最多,样品Xuxx27检测最少的门;在纲的水平,样品Xuxx29检测到最多的77个纲水平的分类单元,而Xuxx27检测到了55个纲水平的分类单元;在目和科的分类水平上,样品Xuxx21的分类单元数量最多,而样品Xuxx27的分类单元数量最少;在属的水平上,样品Xuxx29检测到的属的数目最多,而样品Xuxx27检测到的属的数目依然最少(表2)。从理论上分析,样品的多样性也高,其香农指数也越高,那么得到的分类单元也应该越多。从分类学分析结果判断,检测到最多的门和属的并非是香农指数最高的样品Xuxx25,而是Xuxx29。样品能够检测到分类单元的数量跟样品的香农指数及测序深度有关,样品Xuxx29的香农指数低于Xuxx25和Xuxx24,但是其测序量远高于后者,所以其检测到更多的分类单元。样品Xuxx21的测序量略高于Xuxx29,但是其香农指数低,最终其检测到的分类单元更少。结果显示,海南野生阿宽蕉根际土壤的细菌菌群多样性较好,不同地点的样品其优势菌群也很基本一致。但是不同样品的细菌菌群构成在门、纲、目、科、属等水平上有差别,下面将对门水平和属水平对8个阿宽蕉根际土壤细菌进行分析。