《表1 统计九种鸟类中的常用密码子情况》

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《全基因组分析九种鸟类密码子使用模式》

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为了解析9种鸟中密码子的使用模式，本研究统计了每种鸟类所有编码基因中59种密码子（不包括三种终止密码子，甲硫氨酸(Met）密码子和色氨酸（Trp）的密码子)的使用数目及RSCU值（表1）。最大RSCU值为2.49，对应到斑马雀基因组中编码亮氨酸（Leu）的密码子CTG。RSCU值大于1的常用密码子数在9种鸟类中从28～33不等，说明大多数氨基酸存在多个常用密码子。这些常用密码子第三位碱基的使用偏好在9种鸟类中不同，其中斑马雀、朱鹮、帝企鹅、小白鹭4种鸟的常用密码子第三位碱基为GC-ending倾向；其余5种鸟的常用密码子第三位碱基则为AT-ending倾向（表1）。