《表2 粘细菌-细菌共现子网络节点OTU及细菌节点注释结果》
根据粘细菌?细菌共现网络,大部分粘细菌在网络图中属于外围节点,表现出与其他细菌较低的连通性,但是粘细菌节点OTU 96和OTU 400具有较高的连通度(图2)。在与粘细菌节点有连线的其他细菌节点中,大多数都是革兰氏阴性细菌,但是也有约27%的连接为革兰氏阳性菌(图2,表2)。由于传统的粘细菌分离方法中,大肠杆菌等革兰氏阴性菌作为诱导菌,但是分离出来的多为粘球菌属和珊瑚球菌属等常见种。因此,本研究利用网络分析中与粘细菌有较多联系的放线菌作为潜在的诱导菌进行后续粘细菌的分离。然而,共现网络中与粘细菌有联系的放线菌OTU均为未培养细菌类群。经过进一步的文献检索发现,有研究人员利用稳定性同位素标记技术,将13C标记的球形节杆菌接种于根际,最终在许多粘细菌中检测到13C,证实了该放线菌菌株可能被粘细菌捕食[13]。多序列比对结果表明,球形节杆菌V4区序列与细菌?粘细菌共现网络的放线菌OTU测序序列相似度范围为78.3%~88.9%,具有一定的关联性。因此,我们选择球形节杆菌作为粘细菌的潜在诱导菌,将其用于后续粘细菌的分离。
图表编号 | XD00219029300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.30 |
作者 | 周杨、蚁烁星、张鲜姣、姚青、朱红惠 |
绘制单位 | 广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室、广东省菌种保藏与应用重点实验室、广东省微生物菌种保藏中心、广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室、广东省菌种保藏与应用重点实验室、广东省微生物菌种保藏中心、华南农业大学农学院、广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室、广东省菌种保藏与应用重点实验室、广东省微生物菌种保藏中心、华南农业大学园艺学院、广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室、广东省菌种保藏与应用重点实验室、广东省微生物菌种保藏中心 |
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