《表1 竹子D10基因的氨基酸序列信息》

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《竹类植物分蘖相关基因的生物信息学分析》


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竹子D10基因的氨基酸序列信息如表1,D10基因的氨基酸序列比对结果如图2所示,相似度为77.22%。D10基因的进化树(图3)及motif信息(表2)如下。motif 1、2、3、4、5、9、10对应类胡萝卜素裂解双加氧酶的编码区。草本竹Olyra latifolia和芸香竹的序列较为保守;RguD10b序列缺失motif 4、5、6、7,毛竹PedD10a序列缺失motif 4、5,PedD10b序列缺失motif 4、6、7,这3条序列较其他序列在motif 2前多1个motif 8;瓜多竹的两条序列缺少motif 3。D10基因编码类胡萝卜素裂解双加氧酶(CCD8),参与独角金内酯(SL)的生物合成以及侧根、侧芽的萌发,在根中柱、叶芽、茎、花序和圆锥花序的木质部薄壁细胞中表达[8],植株表现为矮化,分枝和分蘖数增加。D10蛋白定位于叶绿体。Raddia guianensis和毛竹序列中所缺失的片段为CCD8的功能域。