《表3 56K芯片计算亲本和先玉335亲本相似度矩阵》

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《玉米单倍体高自然加倍材料吉Gjb335DH~3的遗传分析与QTL初定位研究》

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根据吉Gjb335DH3重测序得到的874 039个标记计算亲本相似度矩阵（表2）。其中，亲本BSA4-3和BSA3-3相似性最高，相似度可达0.754。亲本BSA5-0和BSA4-3亲缘关系相对较远，相似度为0.506。将亲本重测序结果与先玉335父、母本的56K芯片数据（包含我国骨干自交系，瑞德、兰卡斯特、PB、塘四平头、旅大红骨、欧洲血缘材料，保留了高多态性的标记）合并，找到1 022个重叠标记，根据这1 022个标记计算与其参照亲本先玉335父、母本的相似度矩阵（表3）。发现表2、表3在亲本材料相似度上有较大的不同，表3的计算结果明显偏高，但与表2整体趋势相同。根据56K芯片数据分析经验，70%以上的相似度可以确定是同一亚群或者同一血缘的材料。表3结果说明，亲本1-3、3-3、4-3三者亲缘关系非常近，相似度均达0.75以上。同时，亲本1-3、3-3、4-3与先玉335父本亲缘关系较近，相似度分别达0.818、0.781、0.783。其中，亲本1-3与先玉335父本的亲缘关系更近，也表现出表观性状与遗传背景的差异。