《表3 干旱、DNA去甲基化处理下不同品系间差异表达基因数量》

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《DNA甲基化参与调控马铃薯响应干旱胁迫的关键基因挖掘》

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为了分析不同耐旱型马铃薯品种在甘露醇和5-Azadc处理期间转录水平的差异，使用R包Dseq2对大西洋和青薯9号在同一时间样本的TPM值计算了所有差异基因的表达。以Flod-change>2和校正后P<0.01作为差异表达基因（DEG）的筛选标准。结果表明，在对照（0 h）下，A vs.Q中筛选到1030个DEG，其中有515个上调和515个下调表达基因。干旱处理下，在A vs.Q 2 h中筛选到568个DEG，其中有384个上调表达基因，184个下调表达基因，在A vs.Q 6 h中筛选到994个DEG，其中有560个上调表达基因，434个下调表达基因，在A vs.Q 12 h中筛选到519个DEG，其中有321个上调表达基因，198个下调表达基因，在A vs.Q 24 h中筛选到1251个DEG，其中有471个上调表达基因，780个下调表达基因。DNA去甲基化处理下，在A vs.Q 2 h中筛选到1603个DEG，其中有1033个上调表达基因，570个下调表达基因。在A vs.Q 6 h中筛选到501个DEG，其中有641个上调表达基因，434个下调表达基因。在A vs.Q 12 h中筛选到1153个DEG，其中有576个上调表达基因，577个下调表达基因。在A vs.Q 24 h中筛选到981个DEG其中有465个上调表达基因，516个下调表达基因（表3）。