《表2 湛江湾海洋古菌类群II基因组基本信息》

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《湛江湾表层水体海洋类群Ⅱ古菌的基因组分析》

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湛江湾中筛选出的2个MGII古菌基因组，分别使用注释工具进行注释和统计（表2）。本研究所得的基因组已上传到ncbi，bioproject为PRJNA633442，基因组样品号分别为SAMN14943916和SAMN14943917。ZJW＿bin1基因组中一共含有1 094个contigs，基因组大小为3.08 Mbp，GC含量为44.6%，使用check M根据marker数据集的计算结果显示，该基因组完整度为76%，污染度为14.16%。基因组contigs中蛋白结构域的预测结果显示该基因组编码了3 039个蛋白；ZJW＿bin2基因组中含有432个contigs，这些contigs中蛋白结构域的预测结果显示该基因组编码了1 363个蛋白基因，计算出该基因组的大小为1.26 Mbp，根据基因组中marker基因集的计算结果，ZJW＿bin2的完整度为53.86%，污染度为0.8%。为探究2个基因组的同源性，使用Compare M对2个基因组预测的蛋白质基因进行分析，结果显示，ZJW＿bin1和ZJW＿bin2的平均氨基酸相似度（AAI）为58.85%，2个基因组有237个同源基因。