《表1.不同地区红树林沉积物中的硫氧化菌类群》

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《红树林沉积物中微生物驱动硫循环研究进展》

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用于跟踪硫循环相关的生物分子标记主要是基于编码关键酶的功能基因。目前，硫氧化途径的关键功能基因包括sqr（编码硫醌氧化还原酶）、soxB（编码硫氧化酶）[37]和dsrA（编码反向异化硫酸盐还原酶）。在珠江流域的研究中，定量分析显示具有sox B功能基因的SOB比具有sqr和dsr A功能基因的SOB更丰富，是硫氧化的主要贡献者[31]。在具有sqr功能基因的SOB群落中，披毛菌属（Gallionella）、噬氢菌属（Hydrogenophaga）、Limnohabitans、甲基单胞菌属（Methylomonas）、硝化螺菌属（Nitrospira）、红育菌属（Rhodoferax）和硫针菌属（Sulfuritalea）为优势属；对于具有soxB功能基因的SOB群落中，β-变形菌纲脱氯菌属（Dechloromonas）、Limnohabitans、副球菌属（Paracoccus）、硫针菌属和硫杆菌属（Thiobacillus）丰度较高；而硫针菌属、硫体属（Sulfurisoma）和硫杆菌属在具有dsrA功能基因的SOB群落中数量较多[31]。在红树林生境中，上述3种硫氧化途径关键酶编码基因相对应的菌属尚未对比研究，其结果是否一致有待证实。