《表1 通过Filter-1的微生物在各种样本类型中的丰度及比值a)》
a) T(Tumor):肿瘤组织丰度均值;ANT(adjacent normal tissues):癌旁组织丰度均值;NC(negative controls):阴性对照丰度均值;S(Serum):血浆丰度均值
通过宏基因组测序,本团队在20份样品中共检测到470种微生物,包括细菌、古细菌和病毒,并计算了所有470种微生物在所有样本中的相对丰度(网络版附表1),发现每个物种至少存在于一份样品之中(网络版附表2).从附表2中可以看到,癌旁鉴定出的微生物种类明显多于肿瘤组织,而血浆中鉴定出的种类更多.另外,本研究中的空白阴性对照无论是鉴定为微生物的reads数还是最终鉴定的种类,都超过其他组织样本两个对照所含微生物的种类均超过了1000种,这可能是由于样本收集环境没有免疫系统杀伤微生物所致通过比较G09和G22的肿瘤亚样本、癌旁、血浆发现G22的物种数均高于G09,但没有显著差异(P>0.05).
图表编号 | XD00196144700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.20 |
作者 | 胡宏荣、梁桥星、杨晴、王译辉、王江煌、李聪、魏来、李博 |
绘制单位 | 中山大学中山医学院生化教研室、中山大学中山眼科中心眼科学国家重点实验室、中山大学中山医学院生化教研室、中山大学中山医学院生化教研室、中山大学中山医学院生化教研室、中山大学中山医学院生化教研室、中山大学中山眼科中心眼科学国家重点实验室、中山大学中山医学院生化教研室 |
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