《表1 各试剂的基本情况比较》
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《多种类型检测试剂及不同样本处理方式对新型冠状病毒核酸检测结果的影响》
按试剂特点类型选取4个不同类型的新冠病毒核酸检测试剂盒,分为A、B、C、D四个类型。A型组:新冠病毒(2019)核酸检测试剂盒(批号20200108),检测通道:FAM、VIC、CY5(FAM通道检测新冠病毒基因组的ORF 1ab;VIC通道检测ORF n[2];CY5通道检测的是“人GAPDH基因[3]”,是作为监测采样和扩增质量的内参);B型组:试剂批号20200208,检测通道:FAM、VIC、CY5。与A型试剂相比,B型试剂为了缩短整体反应时间,缩短了逆转录时间和退火延伸时间,升高了变性温度。总体反应时间比A型试剂减少了45 min。C型组:双重荧光RT-PCR检测试剂,批号20200114A,检测通道:FAM、HEX/VIC;D型组:试剂批号20200104A,检测通道:FAM。D型试剂是单靶标检测试剂,其检测靶标是新冠病毒的基因组开放阅读框架ORF 1ab。而且C型试剂与D型试剂均没有设置监测采样质量和扩增效果的内参。以上试剂盒均使用Bio-Rad CFX96荧光定量PCR仪实施扩增检测。各种试剂的基本情况比较见表1。4种试剂检测的靶标序列分别为新冠病毒基因组开放阅读框ORF 1ab和ORF n的序列片段,A、B试剂含GAPDH内参;4种试剂的RNA上样量、荧光通道和扩增循环数及结果判断稍有差异。本研究仅针对相应批号的试剂。
图表编号 | XD00189998400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.30 |
作者 | 王卓、刘宏波、金美松、王旭、黄冠鹏、李兵 |
绘制单位 | 北部战区疾病预防控制中心、北部战区疾病预防控制中心、北部战区疾病预防控制中心、北部战区疾病预防控制中心、北部战区疾病预防控制中心、北部战区疾病预防控制中心 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |