《表2 艾纳香属植物的ITS2序列(来源于Gen Bank)》

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《基于ITS2序列鉴定苗药艾纳香及其近缘种和伪品》

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将测序峰图翻译成碱基序列，再利用Codon Code Aligner进行碱基Q值的质量评估，碱基序列两端的Q值较低，则删除，将反向序列翻译成正向序列，进行序列拼接。采用Keller （2009）基于隐马尔可夫模型的HMMer注释方法去除两端5.8S和28S区段即可获得ITS2间隔区序列。将拼接序列（表2）在Gen Bank数据库中的BLAST校对，确认该序列的种属是否正确。校对无误后，利用MEGA 7.0将其序列与所下载的近缘种和伪品的序列进行多重对比，分析变异位点，以Kimura 2-Parameter （K2P）模型计算种内、种间遗传距离，采用邻接法（neighbor-joining，NJ）构建系统聚类树。