《表2 生脉饮(党参方)治疗ASCVD关键靶点基本信息》
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《基于网络药理学的生脉饮(党参方)治疗动脉粥样硬化性心血管疾病的潜在分子机制》
将119个共同靶点导入STRING中,结果见图3(图中线条粗细代表作用力强弱),将结果以文本形式导出,然后导入Cytoscape软件中,选取Degree,Closeness>平均值的节点作为关键靶点。网络中各节点的Degree平均值为18.16,Closeness平均值为0.46,Betweenness平均值为0.01。Degree,Closeness及Betweenness均超过平均值的靶点有25个(表2),包括蛋白激酶B1(Akt1),MAPK3,MAPK1,TP53,IL-6,Caspase-3,VEGFA,JUN,TNF,PTGS2,EGFR,MMP9,ERBB2,ESR1,CAT,PPARG,IL-10,IL-4,APP,CDK2,NOS2,DLG4,CNR1,DRD2,NQO1,推测这些靶点可能是生脉饮(党参方)治疗ASCVD的关键靶点。其中度值最高的是Akt1,能与69个蛋白发生相互作用,度值紧随其后的MAPK3,MAPK1,TP53,Caspase-3,分别能与61,59,59,58个蛋白发生相互作用。同时利用Cytoscape软件中的MCODE插件将生脉饮(党参方)靶点PPI网络进行聚类分析,(图4)通过对生脉饮(党参方)PPI网络进行聚类分析得出了其中显著性较强的3个模块,其中显著性最强的模块a中包含Akt1,JUN,Caspase-3,Caspase-7,NFKBIA,MCL1等靶点基因,这表明生脉饮(党参方)可能通过抑制凋亡反应发挥作用,其聚类详细信息见表3。
图表编号 | XD00181123700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.05 |
作者 | 杨婷、陈利娜、瞿水清、杨源民、王娅杰、郑钟原、刘慧、郑晓俊、李玉洁 |
绘制单位 | 山西医科大学药学院、中国中医科学院中药研究所、中国中医科学院中药研究所、中国中医科学院中药研究所、广东药科大学中药学院、中国中医科学院中药研究所、中国中医科学院中药研究所、山西医科大学药学院、中国中医科学院中药研究所、中国中医科学院中药研究所、广东药科大学中药学院、山西医科大学第一医院、中国中医科学院中药研究所 |
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