《表2 不同种植方式下土壤细菌Alpha多样性指数》

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《马铃薯与玉米复合种植对土壤化感物质及土壤细菌群落结构的影响》

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J:马铃薯||玉米间作；L:马铃薯-玉米轮作；M:马铃薯连作；Y:玉米连作。不同小写字母表示差异显著（P<0.05）。

利用Illumina公司的Miseq PE300平台对不同种植模式土壤细菌进行测序，数据优化后12个样本共获得330 245条序列，平均序列数在22 619～30 940，平均碱基数在15 648 672～19 059 916，各样本平均长度在376 bp，且差异较小，总体样本序列长度在211～475 bp（表1）。Sobs是细菌群落丰富度的实际观测值，Ace指数和Chao指数是两种常用的对细菌群落丰富度的估计值。Shannon指数和Simpson指数是两种反映群落多样性的指数。由表2可知，间作和轮作的Sobs指数、Ace指数及Chao指数显著高于马铃薯连作和玉米连作，表明间作和轮作土壤细菌丰富度更高；而4个处理间Shannon指数和Simpson指数差异较小，表明不同种植方式下土壤细菌群落多样性差异较小。各样本物种覆盖率均大于0.99，说明本次测序结果可以反映土壤细菌群落结构的真实情况。