《表1 拷贝数改变与表达水平呈显著正相关的驱动基因》

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《食管鳞状细胞癌中驱动基因的多组学关联分析》

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2．拷贝数改变与驱动基因表达水平的关联分析:对20个驱动基因的拷贝数和表达水平进行关联分析，以鉴别拷贝数变异与驱动基因转录水平的相关程度。10个驱动基因的表达水平与其拷贝数改变呈显著正相关（r>0.3，P<0.05），其中PTEN、CUL3、PIK3CA和FAT1的相关系数明显高于其他基因（r>0.5）。在TCGA数据中进行关联分析，结果显示大部分驱动基因（n=14，表1）的表达水平与其拷贝数呈正相关（r>0.3，P<0.05），其中5个驱动基因（CDKN2 A、PIK3 CA、FBXW7、CUL3、RBPJ）的相关系数明显高于其他基因（r>0.5）。8个驱动基因的表达水平在两部分数据中均与拷贝数改变呈显著正相关。