《表2 叶尔羌高原鳅微卫星标记的遗传学特征》

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《基于de novo高通量测序的叶尔羌高原鳅微卫星位点筛选与多态性分析》


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注:PHWE为Hardy-Weinberg平衡显著性检验P值。*显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05);**极显著偏离HardyWeinberg平衡(P<0.01)。

33对多态性的微卫星位点对102尾叶尔羌高原鳅进行遗传变异和遗传多态性检测,引物在叶尔羌高原鳅群体中进行扩增,得到群体的遗传多样性信息见表2。叶尔羌高原鳅的等位基因数介于24~52,有效等位基因数Ne介于4.040~30.626之间,平均等位基因和有效等位基因数分别为43.848、12.163。其中Y96位点的等位基因数最少,为24,Y7、Y11、Y17、Y28、Y32、Y42、Y44、Y49等位点的等位基因数最多,为52。各个位点的香农多样性指数介于2.012~3.699之间,观测杂合度Ho介于0~0.957之间,多态信息含量PIC介于0.729~0.972之间。对各位点进行Hardy-Weinberg平衡检测,发现有22个(67%)位点符合Hardy-Weinberg平衡(PHWE>0.05),有11个(33%)位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡(PHWE<0.05)。与三碱基重复类型微卫星相比,二碱基类型微卫星标记的多态性无论是等位基因数Na、观测杂合度Ho,还是多态信息含量PIC等参数都明显比三碱基重复类型的高。