《表2 EHV-1XJ2015株基因汇总》

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《马疱疹病毒1型XJ2015株全基因组测序及分析》


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由图2可知,XJ2015株全基因组共80个开放阅读框(Open reading frame,ORF),UL区63个,US区9个,IRL区4个,TRS区4个。包含76个基因,其中64、65、66、67号基因位于TRS/IRS区中,为双拷贝基因。各基因功能分析表明,76个基因分为1个极早期基因(Immediate early gene,IE)、55个早期基因(Early gene,E)和20个晚期基因(Late gene,L)。基因35与64分别编码2种蛋白,因此,全基因组共编码78种蛋白,6种调控蛋白,即IEP(IR1)、EICP0(UL63)、EICP22(IR4)、EICPO27(UL5)、IR2P(IR2)和ETIF(UL12)。30种蛋白参与病毒粒子成熟,其中6种与衣壳相关(UL22、UL25、UL35、UL42、UL43、UL56),12种为内层囊膜蛋白(UL3、UL8、UL11、UL24、UL45、UL46、UL48、UL55、US9),12种膜糖蛋白分别是gK(UL6)、gN(UL10)、gC(UL16)、gB(UL33)、gH(UL39)、gM(UL52)、gL(UL62)、gG(US3)、g300(US4)gD(US5)、gI(US6)和gE(US7)。其余42种蛋白主要涉及病毒粒子复制(表2)。