《表2 贵州白山羊DF和SF中上调基因及其功能分析》

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《基于转录组测序筛选山羊卵泡发育相关上调基因》

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选将测序结果比对到山羊的RefSeq数据库后得到33 896个基因，其中FPKM（Fragments Per Kilobase of transcript per Million fragments mapped）≥1的基因有13 644个。使用DESeq2软件对这13 644个基因进行差异表达分析，设置参数：log2(DF FPKM/SF FPKM）>0.5，P<0.05，共获得695个差异表达基因，其中233个表达显著上调基因，聚类分析热图表明样本之间的差异表达基因重复性较好（图1），表2中列出了差异表达倍数最高的10个上调基因及其功能。