《表3 DE-miRNAs在食管鳞状细胞癌miRNA表达谱芯片数据集GSE97049 GSE59973 GSE55856GSE43732中的差异表达》

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《食管鳞状细胞癌相关miRNA的生物信息学分析》

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使用GEO2R分析GSE114110数据集，结果显示共筛查出159个差异倍数达4倍以上的DE-miRNAs，其中上调的miRNA86个，下调的miRNA73个，并绘制了这些DE-miRNAs的火山图（图1），列出了上调幅度最大的10个miRNA和下调幅度最大的10个miRNA（表1、表2）。根据fold change（FC），上调幅度最大的3个miRNA分别是hsa-miR-196a-5p、hsa-miR-196b-5p和hsa-miR-34c-5p；下调幅度最大的3个miRNA分别是hsa-miR-133a、hsa-miR-1和hsa-miR-4770。将这6个DE-miRNAs在食管鳞状细胞癌miRNA表达谱芯片数据集GSE97049，GSE59973，GSE55856和GSE43732中进行验证，与前期分析一致（表3）。通过miRNet预测出3个上调miRNA的514个潜在靶基因及3个下调miRNA的1186个潜在靶基因（图2）。