《表1 miR-326与ACRBP相互作用参数》
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《肝癌细胞miR-326介导的ACRBP转录抑制的研究》
为了探究ACRBP mRNA上是否有miR-326结合位点,本文采用三个在线数据库TargetScan、miRanda和miRDB对调控ACRBP的miRNA进行预测。分析结果显示miR-326与ACRBP 3’UTR区的结合最保守,提示miR-326可能为调控ACRBP的miRNA(图1)。图1显示,miR-326与ACRBP 3’UTR有保守结合位点,且结合处为“8 mer”。表1显示,context++score为-0.43,绝对值较大;context++score percentile为99,靠近100;weighted context++score为-0.43,转录本3’UTR加权分值较小。以上结果均说明ACRBP与miR-326结合位点预测的置信度较高,特异性与保守性较好。
图表编号 | XD00156857200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.30 |
作者 | 包晴、李冰莹、刘俊棋、柳永清、梁晓乐、谢小薰、葛盈盈 |
绘制单位 | 广西医科大学基础医学院人体解剖与组织胚胎学、广西医科大学基础医学院人体解剖与组织胚胎学、广西医科大学基础医学院临床医学、广西医科大学基础医学院临床医学、广西医科大学基础医学院基础医学中心实验室、广西医科大学基础医学院人体解剖与组织胚胎学、广西医科大学基础医学院人体解剖与组织胚胎学 |
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