《表1 6种植物的PHT1蛋白序列信息》

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《中国莲PHT1家族成员的生物信息学分析》


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依据拟南芥、大豆、玉米、水稻和杨树等5种模式植物中已知PHT1蛋白序列的蛋白长度(500~600个氨基酸)(表1),从BLAST检索获得的中国莲PHT1相似序列中删除序列长度不在此范围的冗余序列,再依据这5种模式植物的保守序列比对分析结果(图2),发现删除剩余的中国莲“Phosphate Transporter”基因模型中不含有GGDYPLSATIxSE保守序列特征的冗余序列,最终获得4个满足以上两个条件的中国莲PHT1非冗余蛋白序列。参照拟南芥等5种模式植物PHT1蛋白的命名方式,分别命名为:NnPHT1:1、NnPHT1:2、NnPHT1:3和NnPHT1:4。