《表2 12个待检测的SNPr》
根据已有的基因注释结果,选择位于CDS区引起氨基酸改变的12个非同义SNPr(表2)进行进一步的验证。这12个非同义SNPr所在的基因涉及离子运输、内质网应激、表观修饰等与植物抗逆有重要关系的途径。使用在线软件dCAPS Finder 2.0(http://helix.wustl.edu/dcaps/dcaps.html)搜索SNP附近的酶切位点,并结合软件Premier Primer 5.0设计CAPS/dCAPS引物(表3)。用设计的CAPS/dCAPS引物对已进行田间耐盐鉴定的24个材料基因组进行扩增,并使用相应的限制性内切酶酶切后电泳,检测SNPr在24个材料中的多态性。通过比较分子检测与大田鉴定的结果,进一步确定与耐盐相关的SNPr。
图表编号 | XD00152801200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.28 |
作者 | 王晓歌、舒娜、王俊娟、陆许可、陈修贵、王德龙、王帅、郭丽雪、陈超、叶武威 |
绘制单位 | 中国农业科学院棉花研究所棉花生物学国家重点实验室农业部棉花遗传改良重点开放实验室、中国农业科学院棉花研究所棉花生物学国家重点实验室农业部棉花遗传改良重点开放实验室、中国农业科学院棉花研究所棉花生物学国家重点实验室农业部棉花遗传改良重点开放实验室、中国农业科学院棉花研究所棉花生物学国家重点实验室农业部棉花遗传改良重点开放实验室、中国农业科学院棉花研究所棉花生物学国家重点实验室农业部棉花遗传改良重点开放实验室、中国农业科学院棉花研究所棉花生物学国家重点实验室农业部棉花遗传改良重点开放实验室、中国农业科学院棉花 |
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