《表3 水稻盐胁迫相关tRF的来源tRNA》
表中加粗的tRF后续进行qRT-PCR验证
通过与t RNA数据库进行比较,以至少有一个样品RPM>1为筛选条件[25],与tRNA 5'端序列共比对到145个t RF。与非盐处理的日本晴相比,在盐胁迫条件下的日本晴有77个差异表达的t RF,其中有75个上调表达的t RF,2个下调表达的t RF(电子附表3),以至少一组数据RPM>50数据为筛选条件,共比对到6个t RF,其中有3个t RF的表达量是上升的,其余3个t RF无差异(表3)。以至少有一个样品RPM>1为筛选条件,3'端共比对到78个t RF,与非盐处理的日本晴根系相比,在盐胁迫条件下的日本晴根系有58个上调表达的tRF,其余的tRF无表达差异(电子附表3),以至少一组数据RPM>50数据为筛选条件,共比对到4个tRF,其中3个tRF的表达量上调(表3)。与非盐处理的日本晴根系相比,在盐胁迫条件下的日本晴根系在3'和5'端比对到tRF共有的来源tRNA有2个,分别为tRNA-Glu的EPlORYSAT000373797以及tRNA-Asp的EPl ORYSAT000373840。由此可见,大多数t RF受盐胁迫诱导表达,推测这些差异t RF可能是水稻盐胁迫响应通路中的重要调节因子。
图表编号 | XD00143873300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.16 |
作者 | 孟淑君、张雪海、王琪月、张稳、黄力、丁冬、汤继华 |
绘制单位 | 河南农业大学农学院、省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室、河南农业大学农学院、省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室、河南农业大学农学院、省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室、河南农业大学农学院、省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室、河南农业大学农学院、省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室、河南农业大学农学院、省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室、河南农业大学农学院、省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室 |
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