《表1 与肺癌有关的11条通路》

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《基于网络药理学探讨小柴胡汤抗肺癌作用机制》

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将预测出的71个靶点通过STRING软件进行GO富集分析和KEGG通路注释分析，并以FDR<0.05作为筛选条件。GO富集分析包含3个部分，细胞组分（cellular component），分子功能（molecular function）和生物过程（biological process）。对每个部分，按照FDR值由小到大排序，选取前15条GO条目，利用R Version3.6.0绘制高级气泡图，见图2～4。其中纵坐标为GO条目名称；横坐标为富集因子，其值为小柴胡汤中有抗肺癌作用的71个基因富集在该条GO条目上的个数与富集在该条GO条目上的总基因个数的比值；气泡大小表示富集在该条GO条目上的基因个数，气泡越大，表示富集在该条GO条目上的基因个数越多；气泡颜色表示FDR值，气泡越红，表示该条目的FDR值越小。在细胞组分中mitochondrion的富集因子排列靠前；在分子功能中kinase activity，phosphotransferase activity，alcohol group as acceptor，protein kinase activity和protein kinase binding的富集因子排名较高；在生物过程中negative regulation of cell death，negative regulation of programmed cell death和negative regulation of apoptotic process的富集因子排序较前。通过KEGG通路注释分析得到小柴胡汤抗肺癌作用预测靶点的通路，其中71个靶点参与的通路有pathways in cancer，proteoglycans in cancer，prostate cancer，PI3K/Akt signaling pathway等149条，图5为列举的前15条相关通路。通过查阅文献，149条通路中和肺癌有关的通路有11条，见表1。其中Rich factor表示小柴胡汤中有抗肺癌作用的71个基因在该条通路上的富集程度，rich factor值越大，表示富集程度越高。