《表3 大鼠血管新生内膜形成过程中具有重要作用的miRNAs》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《大鼠颈动脉球囊损伤模型的竞争性内源RNA调控网络研究》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

由于大多数lncRNA的功能未被探明，因此通过共表达分析揭示lncRNA与mRNA的共表达情况，得到lncRNA与mRNA的共表达关系，发现lncRNA与mRNA的共表达关系2322对。通过Targetscan数据库预测与差异表达的lncRNA相互结合的miRNA，得到lncRNA-miRNA关系3361对。通过miRWalk、miRanda、miRDB和Targetscan数据库预测与miRNA结合的mRNA，得到mRNA-miRNA结合关系19956对。将lncRNA-mRNA、lncRNA-miRNA和miRNA-mRNA三者关系进行相互结合，得到三者之间的ceRNA的关系，共包含320个miRNAs、66个lncRNAs和250个mRNAs。根据文献报道，筛选在大鼠血管新生内膜形成过程中具有重要作用的miRNA有24个（表3），取这两部分的miRNA交集，将包含交集miRNA的子网络用Cytoscape绘制，得到最终的ceRNA网络（图5）并进行degree统计。最终共纳入16个miRNAs、18个lncRNAs和46个mRNAs。