《表2 RNA质量控制基本参数》

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《基于转录组技术研究藻蓝蛋白在抑制非小细胞肺癌中的调控作用》


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表型实验结果表明,4.8μmol/L浓度的藻蓝蛋白已经能够引起H460细胞的生长和凋亡发生极显著改变,因此,采用此浓度进行H460细胞的转录组学分析。采用1.3.6节方法将藻蓝蛋白与PBS对照分别处理正常培养的H460细胞,48 h后收集细胞提取总RNA用于转录组学分析。首先对细胞总RNA的纯度和完整度等指标进行了检测。图3分别采用核酸凝胶电泳和核酸分析仪对RNA的完整性进行了检测,结果显示,RNA 18S和28S亚基条带清晰,并且在相应的时间出峰完整,集中程度高;表2显示了RNA质量控制的基本参数,6个样本的RNA总量均超过15μg,OD260 nm/OD280 nm大于1.8,OD260 nm/OD230 nm大于1.5,RNA完整值(RNA integrity number,RIN)均大于8,表明RNA样本完整,没有发生降解,并且纯度和浓度较高,可以进行后续转录组学测序分析。